故事内容延续第一部TV版《攻壳机动队 STAND ALONE COMPLEX》的剧情继续发展。但TV版的2部作品与剧场版无甚联系,可以看做是两个平行世界里发生的事情。这次TV版第2季的制作班底与第一部相同,同时剧情表达上和第一季一样,每话由不同故事构成,各自独立成章,却贯穿着同一条主线。在剧情上同时电影版导演押井守也参与了协力,不过电影版中凄凉的气氛没有在TV版第二季中体现。
托尼·斯塔克(Tony Stark)即钢铁侠(Iron Man),是美国漫威漫画旗下的超级英雄,初次登场于《悬疑故事》(Tales of Suspense)第39期(1963年3月),由斯坦·李、赖瑞·理柏、唐·赫克和杰克·科比联合创造。全名安德尼·埃德沃德·斯塔克(Anthony Edward Stark),是斯塔克工业(STARK INDUSTRIES)的董事长,因一场阴谋绑架中,胸部遭弹片穿入,生命危在旦夕,为了挽救自己的性命,在同被绑架的物理学家何银森(Ho Yinsen)的协助下托尼制造方舟反应